Главный герой Куноичи Сатоко Кусагакурэ, покинув родную деревню ниндзя, попадает в современный город, где знакомится с Конохой, обычной старшеклассницей, подрабатывающей наёмной убийцей. Сатоко обладает уникальным ниндзюцу, позволяющим ей манипулировать материей, и предлагает Конохе взаимовыгодную сделку: кров за помощь в сокрытии улик. Так начинается их совместная жизнь, полная контрастов.
Сатоко помогает Конохе заметать следы после убийств, используя свои способности, а Коноха обеспечивает куноичи жильём и деньгами, заработанными на заказах. Вместе они сражаются с врагами из прошлого Сатоко, при этом наслаждаясь современной городской жизнью и вкусной едой. Несмотря на опасную и нестандартную ситуацию, между девушками возникают тёплые, почти семейные отношения. Они поддерживают друг друга в трудных ситуациях, создавая историю, полную безумных, но трогательных моментов, где ниндзюцу, убийства и повседневная жизнь переплетаются в причудливый, но крепкий союз.