Действие происодит в месте под названием Академия Камоме — то не просто обычная школа. Многие годы о ней ходят странные разговоы, которые сложились в одну большую легенду, известную как "Семь тайн Академии Камоме". Ученица Яширо Нэнэ и её одноклассник Минамото Ко задались вопросами и решили — во что бы то ни стало разгадать эти тайны и выяснить, кто за ними стоит. Заручившись поддержкой мальчика-призрака Ханако, они уже успели раскрыть две из них: тайну Лестницы Мисаки и тайну Четырёхчасовой библиотеки.
Эти расследования подтвердили их предположения о том, что в стенах академии скрываются мистические силы, и пробудили в них ещё больший интерес к разгадке остальных тайн. Каждая новая тайна, с которой они сталкиваются, представляет собой ещё более сложную загадку, угрожающую непредсказуемыми последствиями. Яширо, Ко и Ханако должны действовать быстро и осторожно, чтобы предотвратить потенциальные катастрофы. По мере того как они продвигаются в своих исследованиях, их дружба крепнет, и они узнают, что каждый из них вносит уникальный вклад в их команду. Яширо с её непоколебимой решимостью, Ко с его аналитическим умом и Ханако с его знаниями о потустороннем мире становятся неразлучной троицей, готовой противостоять любым трудностям.
