Сатоси вместе со своим другом и боевым товарищем Пикачу, мамой и профессором Окидо отправляются в путешествие на полуостров Иссю, представляющий собой настоящий тропический рай. Однако сразу после прибытия они попадают на прицел Ракетной банде, и хотя удается отбиться от их козней, команда оказывается в эпицентре любопытного феномена – грозовом облаке, где им удается заметить Легендарного покемона Зекрома.
Позднее при попытке потренироваться перед предстоящими походами по местным додзе, Сатоси с удивлением узнает, что Пикачу лишился своих электрических ударов. Да, Иссю, где 3 раза в год наступает весна, таит в себе немало тайн и гости точно здесь не заскучают. Тем более впереди их ожидают не только товарищеские соревнования с представителями городских клубов, но и бои с мастерами из Региональной Лиги. Пикачу придется вновь встретиться с сильными соперниками из прошлого, а Сатоси найдет новых друзей и даже необычных покемонов.